吳立民（信如）居士著
經文中的咒語部分，因電腦字有限，故多以相似字代替。
序
藥師經典自《拔除過罪生死得度經》以來，凡有五譯，以玄奘三藏所譯《藥師琉璃光如來本願功德經》為最流行，以義淨三藏所譯《藥師琉璃光七佛本願功德經》為最完整。本書釋義、講記、研究以淨師譯本為主而以奘師譯本為輔，蓋取其完整而顯密圓融也。
藥師法是圓融世出世間之法，是圓通顯密之法。是釋迦、藥師、大日，非一非二，本師本尊一具之法。是般若空、般若不空雙顯之法。是法性、法相雙融之法，是曼殊室利、執金剛對揚之法。是了生脫死，即在生活中了生死，以藥物為第一性、性空為第二性來認識人生而改造人生，不離實際，不尚空談，現前腳下立地起修之大法也。
藥師法既不離世間法，故必會通世間自然科學、社會科學以為研究，能破除宗教之偶像、教條和迷信等等。藥師法既不離出世間法，故亦必會通佛法大小乘、顯密教以為研究，才能破除世間之小我、妄執和邪見等等。至於藥師法的本質就是藥師定。《藥師經》是藥師法的說明，藥師法是藥師定的作用，而藥師定的本質就是色、息、心法。人為色息心之一具，修藥師定者，教人明乎自己色息心之所由具，以及如何用此色息心之所具而做頂天立地之人也。亦即教人如何在生活中了生死，而又在了生死中生活也。所以藥師經法是教人生活做人之大法，是教人即生即身認識人身人生而改造人身人生之大法也。釋迦為人間之本師，藥師為人道之本尊，大日為天道之本尊。修密教者，修人道也。而修藥師法者，是正修人道，以人合人，以人合天，天人合一也。故藥師經法，是人間佛教正信正念、正知正見、正定正命之正法也。
佛法三學，定為樞紐。就禪定自身性質而言，能修者為人自身，而所修者亦為人自身，斯即以人自身而修人自身，顯見於外，密藏於內，顯在其中，密亦在其中矣。能修者人，人為色息心之一具；所修者人，而人又為貪瞋癡之一體，轉貪睼癡之一體為戒定慧之一體，轉色身為琉璃光身，又在此色息心之一具。故禪定修法，總不外色法、息法、心法三門。此由人體自性而定，法爾如此，概莫能外。色息心三法具於一體，而一體又分色息心三法之用，三法相通而又法住法位。故三法雖融，卻以因地方法側重不同，而果地證得自然大異。佛法禪定，八萬四千法門，攝之不外如來禪、祖師禪、秘密禪三大類。如來禪以安般入手，都攝六根，較側重於息法，祖師禪以觀心為本體，較側重於心法；秘密禪以六大四曼三密為體相用，較側重於色法。故如來禪為破惑證真之禪，祖師禪為明心見性之禪，秘密禪為即身成佛之禪。人體有色息心三大要素之分支，生活有飲食、呼吸、睡眠三大活動之需要，法門有如來、祖師、秘密三大體系之類別，禪定亦因三大法系而展開。藥師定者，融秘密禪修色之要，會如來禪修息之奧，通祖師禪修心之妙，以大食法（消化生理）修色，解決食色問題；以安般法（循環生理）修息，解決呼吸問題；以入寤法（大腦生理）修心，解決睡眠問題，實為現前做人做事之生活禪也。定有境界，有行相，有果證，皆待實修實證，憑空開口不得。以其在生活中實修實證，故日常做人做事，生活習慣，飲食起居，呼吸睡眠，舉手投足，起心動念，言語云為，心境意識，均為修藥師定之行境，所以會做人生活者，會通藥師法，而不會做人生活者，必不會藥師法，所以修學藥師經法必需做人第一，學會生活。
一九四三年，余曾於顧山侍顧淨緣恩師修藥師大法四十九日。一九四四年又侍師修藥師護摩，大死大活七日，悉地現前，感應持續，是知周易所謂「先天而天弗違，後天而奉天時」；「通幽明之故，知鬼神之情狀」；「原始反終，故知死生之說」，真實不虛也。蓋天人同步，生死一如，法爾如是也。一九五六年，適逢本師釋迦牟尼二千五百年佛誕，師又以該