弘一大師著
凡例
一、經文據《麗藏》玄奘譯本，與世所習誦者異。
二、科依義疑（錄者案——扶桑體具實觀述：《藥師琉璃光如來本願功德經義疏》三卷，收入日本《大正藏》中）。
三、問多增文，答據《義疏》，間或遺略，時有潤文；而觀解表法多缺。
四、唯引他文而略疏釋，引文止處，未易見者，旁加（文）字。
五、若屬私意，則上冠「案」字，以區別也。
六、案經謂此文唐疏者，指《藥師本願經疏》（隋本），唐慧觀撰。係敦煌石室所發現之佚本。
七、經文句讀，據大師寫本。（目次中甲一之「一」，即內文子目之「初」字。）
八、析疑文標點，乃後人所加。